大数据mapreduce俩表join之python实现

二次排序

在Hadoop中,默认情况下是按照key进行排序,如果要按照value进行排序怎么办?即:对于同一个key,reduce函数接收到的value list是按照value排序的。这种应用需求在join操作中很常见,比如,希望相同的key中,小表对应的value排在前面。

有两种方法进行二次排序,分别为:buffer and in memory sort和 value-to-key conversion。

对于buffer and in memory sort,主要思想是:在reduce()函数中,将某个key对应的所有value保存下来,然后进行排序。 这种方法最大的缺点是:可能会造成out of memory。

对于value-to-key conversion,主要思想是:将key和部分value拼接成一个组合key(实现WritableComparable接口或者调用setSortComparatorClass函数),这样reduce获取的结果便是先按key排序,后按value排序的结果,需要注意的是,用户需要自己实现Paritioner,以便只按照key进行数据划分。Hadoop显式的支持二次排序,在Configuration类中有个setGroupingComparatorClass()方法,可用于设置排序group的key值,

实验一:reduce side join(缺点:因为在map阶段不能获取所有需要的join字段,即:同一个key对应的字段可能位于不同map中。Reduce side join是非常低效的,因为shuffle阶段要进行大量的数据传输。)其主要思想如下:

在map阶段,map函数同时读取两个文件File1和File2,为了区分两种来源的key/value数据对,对每条数据打一个标签(tag),比如:tag=0表示来自文件File1,tag=2表示来自文件File2。即:map阶段的主要任务是对不同文件中的数据打标签。

在reduce阶段,相同字段做partition,相同字段+tag做key ,reduce函数获取key相同的来自File1和File2文件的value list, 然后对于同一个key,对File1和File2中的数据进行join(笛卡尔乘积)。即:reduce阶段进行实际的连接操作

student.txt

学号sno    姓名name
01    name1
02    name2
03    name3
04    name4

core.txt

学号sno    课程号courseno    成绩grade
01    01    80
01    02    90
02    01    82
02    02    95

student.py

#!usr/bin/python
import sys
for line in sys.stdin:
        key,name=line.strip().split()
        print "%s\t1\t%s"%(key,name)

core.py

#!usr/bin/python
import sys
for line in sys.stdin:
    key,courseno,grade=line.strip().split()
    print "%s\t2\t%s\t%s"%(key,courseno,grade)

run.sh

HADOOP="/usr/local/src/hadoop-1.2.1/bin/hadoop"
HADOOP_STREAMING="/usr/local/src/hadoop-1.2.1/contrib/streaming/hadoop-streaming-1.2.1.jar"
INPUT_A=/mapreduce/join/student.txt
INPUT_B=/mapreduce/join/core.txt
OUTPUT_A=/mapreduce/join/out1
OUTPUT_B=/mapreduce/join/out2
OUTPUT=/mapreduce/join/out3
$HADOOP fs -rmr $OUTPUT_A $OUTPUT_B $OUTPUT 
#step1
$HADOOP jar $HADOOP_STREAMING \
    -input $INPUT_A \
    -output $OUTPUT_A \
    -mapper "python student.py" \
    -reducer "cat" \
    -file "./student.py" \
    -jobconf "mapred.map.tasks=2" \
    -jobconf "mapred.reduce.tasks=2"
#step2
$HADOOP jar $HADOOP_STREAMING \
    -input $INPUT_B \
    -output $OUTPUT_B \
    -mapper "python core.py" \
    -reducer "cat" \
    -file "./core.py" \
-jobconf "mapred.map.tasks=2" \ -jobconf "mapred.reduce.tasks=2" #step3 $HADOOP jar $HADOOP_STREAMING \ -input $OUTPUT_A,$OUTPUT_B \ -output $OUTPUT \ -mapper "cat" \ -file "./red.py" \ -reducer "python red.py" \ -jobconf "mapred.map.tasks=2" \ -jobconf "mapred.reduce.tasks=2" \ -jobconf stream.num.map.output.key.fields=2 \
-jobconf num.key.fields.for.partition=1 \ -partitioner "org.apache.hadoop.mapred.lib.KeyFieldBasedPartitioner"

实验二:Map side join,思想如下:

两个待连接表中,有一个表非常大,而另一个表非常小,以至于小表可以直接存放到内存中。这样,我们可以将小表复制多份,让每个map task内存中存在一份(比如存放到hash table中),然后只扫描大表:对于大表中的每一条记录key/value,在hash table中查找是否有相同的key的记录,如果有,则连接后输出即可。

实验三:SemiJoin,思想如下:

SemiJoin,也叫半连接,是从分布式数据库中借鉴过来的方法。它的产生动机是:对于reduce side join,跨机器的数据传输量非常大,这成了join操作的一个瓶颈,如果能够在map端过滤掉不会参加join操作的数据,则可以大大节省网络IO。

实现方法很简单:选取一个小表,假设是File1,将其参与join的key抽取出来,保存到文件File3中,File3文件一般很小,可以放到内存中。在map阶段,使用DistributedCache将File3复制到各个TaskTracker上,然后将File2中不在File3中的key对应的记录过滤掉,剩下的reduce阶段的工作与reduce side join相同。

实验四:reduce side join + BloomFilter,思想如下:

在某些情况下,SemiJoin抽取出来的小表的key集合在内存中仍然存放不下,这时候可以使用BloomFiler以节省空间。

BloomFilter最常见的作用是:判断某个元素是否在一个集合里面。它最重要的两个方法是:add() 和contains()。最大的特点是不会存在false negative,即:如果contains()返回false,则该元素一定不在集合中,但会存在一定的true negative,即:如果contains()返回true,则该元素可能在集合中。

因而可将小表中的key保存到BloomFilter中,在map阶段过滤大表,可能有一些不在小表中的记录没有过滤掉(但是在小表中的记录一定不会过滤掉),这没关系,只不过增加了少量的网络IO而已。